很久很久以前，有颗让全世界陷入一片混乱的陨石。
这颗陨石夺走了数不清的人命，也让好几倍的人像是绕了地狱一圈。这些努力从地狱中苦撑下来的人们，开始反过来利用过去让自己陷入破灭的陨石。后来被称为「D源石」的这颗陨石，带给人类无法想象的惊人能量。讽刺的是，它也让人类的科技变得比陨石坠落之前更加进步。
直到出现一批想把D源石的恩惠占为已有的恶徒，又引起一场巧取豪夺。或许，D源石坠落之后，带给人们真正的灾难就是这场争斗吧。
于是，现在世界成了两极化的对立——一方是借着D源石能量来救助他人，一方则是想以D源石能量来威吓他人。
也就是，正义使者对上坏蛋组织。
位于日本关东某处地下室的一处要塞，其面积大到几乎能容下整座大学校地，在由冰冷铁壁覆盖的圆顶基地中，盖了好几座建筑物，并在覆盖圆顶基地的墙壁里铺设了数不尽的管线，目的就是在维持建筑物。
建筑物一个个被设计成金字塔型，各自具备不同功能。这些全都是从早到晚、费尽心思、想从人类手中夺走D源石的坏蛋组织——「黑色子弹」的根据地。
先看看位于东侧的其中一座金字塔吧。
东侧这座金字塔分配给黑色子弹——一般称为B B团——的战斗部。在那里，战斗人员除了制定抢夺D源石的计划，也进行训练，并且制造B B团的王牌——「改造人类」。简单一句话，这就是B B团里专干坏事的部门。
这时，在东馆的走廊上正好有人经过。
「作战司令室……武器管理课……呃——呃……」
走在前面的，是个五岁左右的小女孩。
她穿着一件黑色小洋装，依照自己的步调往前走，裙襬轻轻地飘动。
为什么小女孩会在坏蛋组织里呢——这个问题暂且摆一边，小女孩一边走着，一边一个个地念着房门上标示的门牌。
「这几个字念作『废弃处理场』。因为很危险，蓓蓓不可以靠近哦。」
走在小女孩后方的是一名身材魁梧的男子，身高大约两百公分吧。可能需要有十个像这个叫蓓蓓的小女孩浓缩起来才能构成这样一名男子。像刚才蓓蓓停下脚步的那间废弃处理场房门，这名男子如果不费力弯下腰是进不去的。
「这里是干嘛的？」
蓓蓓指着废弃处理场的房门。
「简单来说就是垃圾场呗。」
回答的是站在魁梧男身后的平庸年轻人，他那张平板的脸上有双瞇瞇眼，要说特征就只有这样吧。这两人都穿着黑色紧身衣，几乎所有B B团的成员都是这身制服，也可当作战斗装。
「1号，你昨天进去里面修理了呗？我记得好像有爆炸意外。」
瞇瞇眼男指着房门。
「哦哦——是啊是啊。有人搞错了，把TNT黄色炸药混到垃圾里，结果弄得一团乱……说不定还有火药残留，所以不能进去哦。」
「好！」
1号弯下高大的身躯叮咛着蓓蓓，蓓蓓则展现儿童本色，精神饱满地回答。
「接下来我们就各自开始今天的工作！2号先到作战会议室换灯泡，我去训练室修理长椅，蓓蓓到其它地方巡逻！」
「了！」
「好——的！」
在1号的一声号令之下，被称作2号的瞇瞇眼男和蓓蓓都充满活力地举手响应。
他们都是隶属于B B团补给部的「生活课」。就算是拥有精良科技的凶猛组织，在里面生活的也是凡人，食衣住行等各类生活必需品都不可缺，而负责补给以及处理「其它杂事」的，就是生活课了。也可以说，这个让全世界陷入恐惧的恶魔集团，就是在他们这群无名小卒的默默努力下支撑着。
这三名生活课团员意气风发地迈步离开。
「废弃处理场……」
蓓蓓一字字念着门牌上的字。
「咦？」
她走到隔壁房门时停下脚步。
「嗯？怎么了咀？蓓蓓。」
2号也朝着蓓蓓的视线望去。
只见蓓蓓盯着废弃处理场的隔壁房门。虽说是隔壁，但因为废弃处理场相当宽敞，与隔壁房门的距离约有五十公尺。
那个门口站了两个人。
身穿黑色紧身衣的战斗人员在门口徘徊不定。
「怎么啦？」
「啊，是蓓蓓！」
战斗人员像是获救似地看着蓓蓓他们。
「生活课的人，来得正好！」
这扇门后方是男厕所。B B团的厕所跟其它办公大楼不同，入口也有一道门，看起来跟其它房间长得一样。之所以将所有房间的外观统一，就是因应敌人来袭时可利用障眼法来掩饰其它重要的房间。
「怎么回事啊？」
「这个啊，就是这扇门！」
战斗人员扭捏地敲打着门。
这扇门跟其它课的房间一样，都是用钢铁制的自动门，旁边有个