距离月影百合成为Cure Moonlight已经过去了两年。
Cure Moonlight连续打败了蝎子莉娜、蜘蛛嘉吉和眼镜蛇拉加三干部所创造的Desertlien，解救了被夺走"心之花"的人们。有时候她也直接与三干部之一对决，但从未败过。
她的战斗表现非常出色，逐渐接近之前的被称为历代Pretty Cure中最强的存在Cure Flower。
其中一个重要的原因是Cure Moonlight与Cologne的搭档关系。
无论她们连续取得多少胜利，她们都会分析当天的战斗情况，并且以此为反思，作为下一场战斗的经验积累。
月影百合升入明堂学园高中部后气质变得成熟，而Cologne的嘴依旧不饶人，但却能精准分析敌人并提出建议，花咲熏子对她们十分满意。不过，她也认为能够连续战胜的原因是三干部尚未合作攻击过她们。
熏子自己是Pretty Cure的时候，"沙漠使徒"的干部们合作过，使她多次陷入困境。但每次都是Coupe拯救了她，所以没有造成大问题。
相比较当时的Coupe和现在的Cologne，Coupe在各个方面都要优秀得多。虽然现在他平时只是呆呆地待着，但一旦危机来临，他拥有足够的能力去打败干部们。
然而，Cologne是一位正在成长的妖精，没有足够的能力。如果干部们一起袭击的话……
此外，熏子对两年前"沙漠使徒"进行电波劫持时出现的面具男子的存在很在意。
那个坐在王座般椅子上，在三干部身后的面具男子并不是杜恩。然而，从他的气场来看，他的地位和战斗能力上都超过了三干部，毫无疑问。
如果面具男子出现在Cure Moonlight面前……
──果然，需要像我走过的路一样，把Cure Moonlight带到Pretty Cure宫殿，让她接受考验。
熏子在心里喃喃自语，但很快摇了摇头。所谓Pretty Cure的试炼，就是为了获得能无限激发Pretty Cure力量的"HeartCatch Mirage"，必须与前代的Pretty Cure对决并取得胜利。
熏子能够与"沙漠使徒"的首领杜恩战斗不分伯仲，多亏了那个"HeartCatch Mirage"。然而，熏子在成为Pretty Cure后的两年半才得到"HeartCatch Mirage"。是当"心之种子"装满了"心灵之壶"的时候。
月影百合收集的"心之种子"还没有填满"心灵之壶"。
考虑到百合成为Pretty Cure还只有两年，她是否能够克服Pretty Cure的试炼，熏子不禁犹豫起来。
当然，现在的熏子没有与百合战斗的体力。她认为只能让Coupe代替自己去战斗。
如果Coupe毫不留情地战斗，即使是与三干部互相匹敌的百合也没有胜算。当熏子与前任的Pretty Cure，Cure Rose战斗时，虽然她比现在的熏子年轻约20岁，但战斗是毫不留情的真刀实枪。可以说是一场真正的生死之战。
──我不能让刚刚开始热衷于Pretty Cure使命并努力奋斗的百合尝到挫折。
熏子这样想着，决定再观察一段时间。
实际上，正如熏子所想的那样，沙巴克博士也命令三干部协力击败Cure Moonlight。然而，虽然他们当场表示同意，但实际上三人只愿意一个人战斗，这让他感到焦躁。
在大约一年或两年后，杜恩会来到地球。如果在此之前不将地球变成沙漠，沙巴克害怕自己的生命受到威胁。迪恩是一个残暴的男人。
在恐惧和焦虑中，沙巴克对生命培养装置进行了加速少女成长的操作。少女经历了快速成长，但代价是她的背上的翅膀变成了单翼。虽然她是人造人，但由于将她当作女儿一样培养，沙巴克对此感到悲伤。
然后，终于到了那个少女从生命培养装置中出来的时候。
沙巴克给她起名为Dark Pretty Cure，并给予她一套黑色哥特洛丽风格的服装。但他不允许称呼自己为父亲。
沙巴克和Dark Pretty Cure之间更像是主仆关系，而不是亲子关系。没有"心之花"的Dark Pretty Cure对沙巴克的命令绝对服从。
沙巴克最初给予Dark Pretty Cure的任务是调查Cure Moonlight的真实身份。
之前他曾给那些不与Cure Moonlight交战的干部分配过这个任务，但他们的杀气太重，被妖精Cologne感知到并多次失败。
"你不需要与Cure Moonlight战斗，专心调查她的真实身份就行了。"
"是。"
Dark Pretty Cure行了个礼后离开了房间。
当Dark Pretty Cure抵达希望之花市时，正是眼镜蛇拉加创造出的Desertlien被Cure Moonlight打倒并夺回"心之花"的时候。
Dark Pretty Cure隐藏在离火车站稍远的公寓楼顶上，窥视着Cure Moonlig