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受到亚兰的招待，尊、明理、御成到访了眼魔世界。
尊在眼魔世界再度遇上西园寺，得知父亲对英雄幽灵眼魂所附托的意志。
受到伟大之眼消失消息的冲击，西园寺极为气愤，从而召唤出达芬奇的眼魔。
将失控的达芬奇眼魔解放后，自蒙娜丽莎的画像中诞生出达芬奇幽灵眼魂。
西园寺在感受到龙的意志下，离开了尊等一众人。
（两年后）
【V-CINEMA】
亚兰等人透过植林等踏实的方法努力下，令红色的天空稀薄了不少，此外在明理及伊戈尔的协力下，正进行大气改造装置的开发。
在流星群的冲击下，于宇宙漂流的宇宙牢狱坠落于眼魔世界之上。
从中出现的丹顿再次与诚相会，并透露了他是诚的真正父亲。
丹顿将处于冷冻睡眼状态的克洛伊复活，并进行演说，告诉众人改造大气是白费的，只有肉体改造才能得到未来。
诚被丹顿所说的话打动了心灵，开始与亚兰对立。
在亚兰抱着对诚所拥有的强烈友情下，使Necrom幽灵眼魂变化成友情爆发幽灵眼魂。
虽然他以假面骑士Necrom友情爆发魂令Deep Specter陷入困境，但却因吃了对方一记突袭而被打倒。
另一方面，丹顿知道了花音因为红色天空的影响，会经一度死亡，因此将她视为失败作打算将她葬送。看见这情况的西园寺因出手保护花音而死亡。
诚决意背负着所有罪恶而生存，使Sin Specter幽灵眼魂诞生，让他成为了假面骑士Sin Specter，将成为了超进化体的丹顿击破。
在丹顿动手脚下，大气改造装置被改装成加强红色天空带来的影响。但在御成等人大展身手下将它变回正常运作。最终红色天空消失，眼魔世界再次被蓝天所包围。
失去作为父亲的丹顿后，克洛伊感受到她再没有生存的意义。
尊则告诉克洛伊，要为了自己而生存下去。
在为福嶋文进行第三次忌日拜祭时，尊等人再次集合在一起。[小说]