到了比利小子幽灵眼魂。
明理、御成利用蜘蛛灯的力量，从西园寺手上夺走了比利小子幽灵眼魂。
尊知道了假面骑士Specter的真正身分，就是他昔日的童年好友·深海诚。
【假面骑士X假面骑士Ghost&Drive 超MOVIE GENESIS】
尊为了调查超常现象再次与泊进之介相会。
在虫洞的力量下，尊及进之介被送到十年前的时代。
于十年前的世界中，尊与进之介意图阻止父亲·龙的死亡，但龙却因为挡下了自达芬奇眼魔向尊所射出的魔弹而失去生命（在虫洞打开下驱使了另一个过去发生，使龙的死亡方式不同）。
透过龙的力量尊及进之介返回现代，再度与达芬奇眼魔对决，并获得胜利。
【第九话】尊的生命期限：二十七日~二十六日
透过五十岚健次郎所拥有的「扇子」使弁庆幽灵眼魂诞生。
尊知道了诚的目的，就是要使被囚于眼魂内的妹妹花音死而复生。
【第十话-第十一话】尊的生命期限：二十六日~二十二日
西园寺集齐十五个英雄幽灵眼魂，召唤出伟大之眼，并许愿「希望得到支配所有东西的力量」，但因为资格未够而无法实现，身体被粒子化后被石碑所吸收。
尊向伟大之眼许愿让花音死而复生。
十五个英雄幽灵眼魂扩散开去，再次各散东西。
御成获得五右卫门幽灵眼魂。
尊与诚击退了变身成上级眼魔的谢贝尔。
【一休眼魂争夺！以机智决胜负！！/一休入魂！觉醒吧，我机智力量！！】
尊与眼魔在钝智对决中胜出，获得一休幽灵眼魂。
尊与诚等人为了能纯熟使用一休幽灵眼魂而展开特训。
尊与诚各自变身成一休魂及毕达哥拉斯魂，打倒了眼魔。
二零一六年
【第十二话】尊的生命期限：零日（二零一六年一月十日）—九十九日
在同伴们积极奋斗但徒劳无功下，尊的生命终于到达了九十九日的期限。
尊被消灭后与父亲·龙再会，得到了斗魂Boost幽灵眼魂，并返回现世。
尊再度获得99日的期限，并在龙托附「将英雄的心灵联系一起，并引导未来」这个新使命下再次收集十五个英雄幽灵眼魂。
【第十三话-第十四话】尊的生命期限：九十九日~九十四日
尊与身体被龙马幽灵眼魂依附的田村长正相遇，透过连结父子的「萨长同盟」，变得能与龙马幽灵心灵相通。
【第十五话】尊的生命期限：九十四日~八十六日
诚在通过胡迪尼所赋予的试练下，首次能够使用胡迪尼幽灵眼魂，再度将谢贝尔击破。尊变成能够与武藏幽灵心灵相通。
【第十六话】尊的生命期限：八十六日~八十日
亚兰从眼魂世界带走了NECROM GHOST眼魂及润眼手环，并以假面骑士NECROM的身份于尊和诚面前出现。
尊变得能与罗宾汉幽灵心灵相通。
【第十七话-第十八话】尊的生命期限：八十日~七十三日
被卑弥呼幽灵眼魂附身的日野美和子造访大天空寺，牛顿幽灵眼魂因为难以与卑弥呼共处而离家出走。
伊戈尔从眼魔世界来袭，开始藏身于人类世界秘密活动。
亚兰强行令诚变身成假面骑士Necrom Specter。
尊赶至明理及御成与伊戈尔战斗的现场，并与卑弥呼幽灵心灵相通。
尊与花音看见被亚兰所操纵的诚感到惊愕。
尊了解到牛顿与卑弥呼间之关系，开始能够与牛顿幽灵心灵相通。
【第十九话-第二十话】尊的生命期限：七十三日~七十日
尊与画材眼魔相通，首次打算与眼魔成为朋友。
尊与信长幽灵及图坦卡蒙幽灵一起使诚从Necrom的咒缚中解放。尊能与弁庆幽灵心灵相通。
【假面骑士1号/传说！骑士之魂！】
尊与传说的假面骑士1号·本乡猛一起，对抗修卡及新星修卡。
在战斗最白热化之时，本乡猛丧失了性命，但燃烧着他肉体的火炎再次附在他的灵魂上，并且在立花麻由的魂之呼唤下，再次复活。
假面骑士1号与地狱大使一同透过亚历山大眼魂，将失控的新星修卡怪人鸟鲁加击破。
受到神秘少女·弗雷雅的委托，尊与诚开始了假面骑士眼魂的搜集。
在他们承继着假面骑士眼魂的力量下，将狙击弗雷及弗雷雅的斯巴鲁巴击破。
在尊及诚搜集的六个假面骑士眼魂，及弗雷雅所拥有的十个眼魂下，诞生出假面骑士45幽灵眼魂。
暗黑意志透过亚历山大眼魂的力量，使新星修卡复活。
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