很可能会演变成人类之间粗暴的物理对决，无法期待他们会让超级EVA脱离战场。
真嗣无奈地进入周围一带弥漫得很严重的水蒸气之中，将天使载体形成角锥塔四个底角的杖状武器从地面上拔起一根，然后让超级EVA浮上因为战场热量招来雨云，导致降起臭氧味大雨的天空之中。「我们回家吧。」
这时他的硬化状态也解除了。他一面回头看著仍紧抱在身上的特洛瓦，一面有点苦涩地笑起。「请你差不多该松手了，我的脖子渐渐喘不过气来了。」
「手麻了──动不了。」特洛瓦似乎露出很不好意思的表情来了。
■各自的归途
真理根据自我判断操纵著beast EVA脱离战场，新获得的QR纹章透著静谧光芒，尽管不到巨大化载体的程度，但变大一倍的机体与装甲即使在塔的影响消失之后，也依旧以这个尺寸稳定下来。
在与战场保持距离绕行的联合国巨人机上，NERV USA职员看到USEVAbeastWolfpack暂时恢复的遥测资料后，被该机体的变化吓了一跳，并在看到驾驶员真理的生命资料时愕然失色。
方才跟真嗣他们应该就像是意识相连般自由对话的真理，现在实际上却只能发出像狗一样的鸣叫声，无法言语。折叠起四肢和她一起进入插入栓的支援机器人发出警报，告知施打药剂之中有好几剂不再被真理的身体吸收。
她的话语从以前就让人难以理解意图，所以为了得到沟通的头绪，在系统介面上安装了印象绘图机，如今虽有将她的思考拼成文字显示在通讯显示器上，却怎样都无法理解。
姑且不论Wolfpack在获得QR纹章时附加与增加的异常能力，要说技术人员们没有预感到真理迟早会变成这样是骗人的，联合国机内的美国管制室弥漫著一股内疚的气氛。不理会这种气氛，半兽半机的野生「群体」没有听从空中管制室下达的命令，沿著地形一路南进。
这架美国制造的EVA也有装设好几道能远距离限制行动的安全装置，但是在失控时不会考虑人类情况的类生物组织影响下，不是被无视，就是被切断了。只不过，Wolfpack的尺寸与质量都已变大一倍，就算让它停止运作也无从回收……
真理操纵的Wolfpack在跑到长型的新地岛南端后并没有停下步伐，而是朝著巴伦支海纵身大跳。
被问到目的地，真理以简短的字串回答〈明日香那边〉。
或许是看到了强行把头钻进在场职员之间，一起探头看著显示器的黄金猎犬茉茉吧，她随即补上〈把茉茉带到绫波零No.Six与安土那边〉这一行字。
要职员们把狗平安送还到箱根岛NERV JPN──希丝──手上。真理并不知道希丝超过第二宇宙速度下落不明的事。
尽管曾派遣飞机追随从海面露出头部往南游去的US EVA beast一段时间，不过在抵达该海域自西方伴随著浓密电磁云袭来的暴风雨前线后，他们便无法再追踪下去。在没有卫星的现在，这头无须救援的巨大野兽，就在因为巨大化月球的潮汐力掀起惊涛骇浪的大海失去行踪。
超级EVA飞行在已经就连白昼都会闪烁极光的北极海上。这是因为特洛瓦对于要再度使用转移网路表示了不安。
多亏远方的真嗣心脏将能量传送过来，尽管不多也还是降低了QR纹章的影响。不过这样一来，他们或许难以使用那个地下回廊。
然而绫波No.特洛瓦有一半染成黑色的头发没能恢复原貌。尽管如此，如今的她虽然面无表情，脸上却得有些心情愉快，摇曳著从清澄的水色染成深黑的秀发。
在以Vertex之翼进行次轨道飞行，要一口气飞往日本的最终加速之前，真嗣与特洛瓦打开插入栓探出身子，外头的空气冰冷荒凉，让人回想起补完计画最初的实验场地「苹果核」上的那片沙漠大地。前往远方的旅程到此结束。为了迈向更加遥远的旅程。
在膨胀后接近到令人生厌的月球自东方的天空升起。
绕行地球的朗基努斯环比起夺走真嗣心脏并贯穿地球的时候更加延伸，天空中那道看不见的间隔变得愈来愈短。会在近期内连接起前后两端成为真正的环，据说地球将会在那个时候毁灭。
剑介之后就没再出现了。在新地岛负伤，以意想不到的方式让仿生义手换成自己的培养手臂的NERV JPN代理副司令铃原冬二，由于仍躺在担架上无法起身，所以跟著战自先遣队的春日二佐等人一同归国。
他们的目标是箱根。
与月球膨胀成反比例的地球直径大幅收缩导致了接连不断的地壳变动。这让世界各地的地形剧烈变动，就连他们要前往的箱根也变得截然不同，本来连接本州与半岛的根部地区受到大深度地壳消失的影响下陷数百公尺，意外地让箱根山火山臼在半岛与本州之间的海峡中形成岛屿。
而NERV JPN正持续搜索著在次轨道飞行中无法停止推进器，不断加速导致目前下落不明的小不点零No.希丝。在海底缆线寸断、卫星飞散的现在，他们让世界各地赖以维持通讯的贵重平流层飞船将天线朝上空伸去，并与电波天文台交涉，想尽办法要找出她所搭乘的F型零号Allegorica。
在搜索过程中，他们接收到微弱的特徵讯号，这道无人飞机用来通报自机位置的讯号，是来自在新地岛作战时，欧盟联合军为了确认Torwächter与明日香整合体开启的「窗口」通往何处，所派去闯入「窗口」的幸存机体。讯号方向指著月球。
只不过，更进一步的事态变化，正在人类所无法前往的地下进行著。现在芦之湖的水位已大幅下降。湖水在发生了许多事后，目前流到了NERV JPN基地正下方，旧Geofront区域里了。
在这个Geofront的封印区域，包覆著旧本部设施的巨大HTC高硬度似曜岩混凝土制石棺半球体之中，有著在中央核心区停止活动的莉莉斯。莉莉斯在补完计画失败后就与往后的世界隔绝关系，连同周遭空间一起让时间停滞，真嗣的父亲源堂与赤木律子博士