■灭亡步骤
绫波零No.卡特尔虽然开炮攻击真嗣，却没残留任何物质、能量或足迹，带着0·0EVA一起在雾里消失无踪。
以精神镜像连结控制她的，则是众绫波灵魂的主人，零No.特洛瓦。
因此无论这次卡特尔的叛乱是过失或故意，特洛瓦都有主导嫌疑，而遭到监察室与情报部严加审问。
但是对于零No.特洛瓦而言，他们的声音宛如隔着一道墙般遥远。
别说No.特洛瓦，连No.珊克、希丝的声音也听不到。
与其说失去姐妹，倒不如说自己的身体缩得很小很小，而且失去手足动弹不得。内心这么想的她，选择封闭自我。
零No.特洛瓦被关起来，最先来探访的人是明日香，房门随着一阵骚动与怒喝开启。
明日香粗鲁地甩开监察室人员的制止登场，带着呜咽质问她。
「为什么……！」
到了这时，零No.特洛瓦才晓得监察官说她的分身零No.卡特尔杀害真嗣一事不假。
尽管能解读绫波平淡表情的人很少，不过明日香能够从零No.特洛瓦脸上看出卡特尔的失控并非出于绫波的意志。
然而，即使明白这点，已经发生的结果也不会有任何改变。
气急败坏的明日香，揪住绫波的制服衣领把她拉起来。
「我不会轻易认定他已死，因为我还没偿还三年前欠他的债。」
初号机被贰号机拖回去后，并非放在主要使用的第一整备室，而是先前长期封锁的第二整备室。第二整备室尽管是备用，却是目前总部设施里最旧的部分。这个位于旧Geofront外缘北部地下深处的地点，同样在三年前总部战时被打穿了天花板，量产型EVA就是在此解体。
为了确认真嗣的生死而扫描F型初号机内部后，不只技术部的人，就连科学部的人也不知所措。
——不明白究竟是怎么回事。
别说找到插入拴与真嗣的影子了，就连EVA的巨大骨骼构造、内脏、肌肉、体内器官等等的物理性境界都不再明确，开始模糊混淆。
在老旧整备室的控制室里，工程师擦掉萤幕上薄薄的积灰，可是眼中所见的异常现象并未改变。
初号机拘束装甲遭到贯穿，上头就像投入大石的水面一般，有处融化飞溅的痕迹。0·0EVA的特强伽玛射线烧穿装甲，于是内部产生的瞬间汽化——也就是大爆炸，把体内搅得一塌糊涂。可是单单以此解释还不够。各种边界全都逐渐消失，骨骼也不例外……在三千六百吨的身躯遭到自身体重压垮前，整备室里紧急灌满了LCL。
初号机由F型拘束装甲所裹住的巨大人型部分，处处都逐渐变得一致，仿佛EVA的身体忘记了自己曾是EVA似的。只有一个部位除外——
步向死亡的身体内有个与众不同的地方，往外释放的能量多到有危险。
2S机关。
过去捕食使徒塞路尔的组织，在初号机体内与核心融合而产生的动力源。不仅是让初号机摆脱供电缆线的动力炉，更是存在的发动根源。
与暴走时相当的力量，目前就在该处不规则地出现又消失，显得极为不稳定，还发出有如远方地鸣的声音。
真嗣此刻别说生死，就连存在有无都不清楚，紧急排出不得不暂缓。因为无论做什么，都得先停下处于暴走状态的2S机关。
理由只有一个，避免能量解放造成第三次冲击。
人们必须想办法控制住有如沸腾大油锅般的2S机关，顺利让失去主人的力量散掉，让初号机迎接安静的死亡。
然而事与愿违，情况更显恶化。
「2S机关的半径正在改变……渐渐掉到『另一边』了——」
在深夜敲定的全市民避难，等到天亮后气温上升才实施。包括第三新东京市在内，在箱根山火山臼范围内生活的民众开始往外避难。
由于无法确定初号机会在哪个时间点暴走，因此联合国拒绝提供EVA运输机。即使有让0·0EVA升空用的推进器，此刻无法随意张开绝对领域的初号机依旧无法使用，丢到远方这条路行不通。
——只能在箱根解决。
目前人潮塞满了交通工具。对民众的说法是，发现都市结构受到严重而需要紧急处理的损伤，而且影响范围广大，为了尽快且顺利地复原而请大家暂时离开。
尽管复原作业确实有在进行，不过全都会中途放弃。等到民众避难完毕后，作业人员和NERV职员就会放弃剩余作业逃离此地。
日本国政府则是以答应NERV JPN要求的形式，在联合国租界箱根山火山臼通往外头「日本」的干道与铁路车站部署战略自卫队。大部队将以保护避难民众的名义设下检查哨，盘查第三新东京市民并将他们送往外界。
青叶茂混在等待巴士的队伍之中，他事先以人工皮肤与假资料隐形眼镜变装，还拿着集情报部伪造技术大成的ID卡。如果要问现在的他有什么可疑之处，就是穿着风格还留在上个世纪。战自的闸门主官虽然一脸狐疑，不过对方声称是个人喜好也无可奈何，于是闸门亮起绿灯放他通行。
背着吉他的青叶，目的是请大学时代的恩师提供协助。
如果搭联合国的直升机出来就不用如此麻烦，但在那种情况下，顶多就是令提防专业知识与人才外流——尤其是外流到NERV——的日本国政府，安排一个会让他与目标擦身而过的舞台。