UNE的门外，PAOFU看到十分惊讶。达哉为众人解释，在「那一边」出现和这一样的太空船称为SYBARBER，在船内最好不要想坏的事情，因为它会把事情实现。由于这是因为人们的恐惧、不安和期待，所以利用传言去造成的东西，也就是无意识之世界的实体，因此和菲利文的地方一样，可以把事情实现。丽听来好像很放心，说只要想一些好的事情便没有问题。但达哉叫众人最好什么也不要想，不要忘记这是「那家伙」的地方，跟着众人便进入太空船之内。进入去不久的众人，已经出现不得了的事情，四周也变得十分之热，他们像是热锅上的蚁一样乱跳，最大的问题是门不能开。PAOFU问是否丽在乱想，但丽却否认是她，原来因为达哉想起「那一边」相同的事而变成这样。克哉问当时他们如何渡过的，达哉想起了那时舞耶一边说着开门的话，一边带在大家冲前，于是众人便照版煮碗做一次。
当众人到了B3「嘲骂之间」，丽被房间内的情景吓得跌了在地上，一大班的天诛军躺在血泊之中。众人也在猜想是否「那家伙」的所为，为什么把自己的手下杀了。达哉猜想「那家伙」为了毁灭证，要把所有知道它存在的人杀掉。到了B5的「纠弹之间」后，丽因为很累而不能再行。丽和克哉问为什么这里没有回复之泉和VELVETROOM，这时达哉告诉众人出现了。由于丽和克哉在想，所以他们的想法实现了。克哉问为什么「那家伙」会造出方便他们的事，达哉知道它为了和他们游戏。PAOFU说不要管它想如何，反正可以利用便是。于是四人便分别进入那两间房内，留下了舞耶和达哉二人。达哉走到墙边坐下，舞耶也坐在他的身边。达哉和舞耶相坐而无言，当达哉站起来的时候，舞耶终于开口和他说话。达哉因为自己犯下的罪而内疚，所以忽然略有所思。突然从回复之间和VELVETROOM中，走出了金属型态的荣吉、莉莎和淳。达哉知道三人是因他一时的思念而造出来的，并且叫舞耶后退。当达哉挥刀向金属淳斩下时，发觉无法伤害它。「达哉…我们一起守护舞耶的承诺是谎话吗？」达哉听到这番话时显得有点困惑，「好吧…不要再一个人痛苦了」金属淳说完后便和达哉他们一起消失。这时候丽她们也从房间回来，问为何不见了达哉。舞耶托盘后众人感到达哉会有危险，于是众人便立即去找达哉。
众人在B6找到了「呵责之间」，在房间入面看来和荒屋神社差不多。达哉躺在祭台之上，三位金属人围着他。淳叫达哉不要再受苦，跟着便举剑向他的心房刺去，达哉单手把淳的剑接着。这时克哉等人也赶到来，克哉看到弟弟有危险，于是便向金属人开了几枪。不过克哉的子弹无法伤害他们，PAOFU说物理攻击似乎不行。达哉从祭台跳下来后说：「我会接受惩罚的，可是现时不能」，跟着便和三位金属人发生战斗。因为面前的三人是前作的主角，所以他们的魔法攻击力十分之强劲，尤其是他们的黑暗魔法，随时随地也可以把玩者全灭。因此玩者要准备一些拥有魔法无视和反射的PERSONA，最起码也要防黑暗魔法。另外战斗前克哉也为各位示范过了，物理属性的攻击会完全不奏效。好不容易才把三位金属人击倒，克哉为弟弟包扎伤口，达哉尴尬地向克哉道谢，在体内这世界的达哉也能感受到。他听到达哉这样说后，便走到一旁擦眼泪，看到这两兄弟的感情，众人也十分感动。
为了要破坏龙藏的计划，舞耶等人便加快步伐。不过如果装备和道具不足的话，可以到B7的「转送之间」。那里有一台可以直接出到荒屋神社的转送器，玩者可以利用来补充足够的物品。众人终于来到了太空船的控制室，不过在里面等待舞耶她们的并不是千军万马，换来却是尸横遍野的场面。克哉第一时间上前查看，发现有一位天诛军还未死去，他告诉克哉他们，是管原陆将变了一头怪物，并且四处杀害同伴。这时候在众人的背后传来了一些古怪的厮叫，眼前出现了头恐怖的怪物，相信是那士兵所说的管原陆将。忽然四周发生了一件比看到管原更震撼百倍的事，以珠闲留市华莲台为中心，从地面出现了一座古城，跟着整个珠闲留市被TORIHUNE载上半空之中。
达哉向众人道，相信龙藏一定在那座城里，而且龙藏只欠把「污秽」（JOKER）释放出来，便可以完成他毁灭世界的大计。他们现在还未曾输的，不过首先要把管原那丑陋的怪物打倒。管原这只怪物的攻击并不恐怖，麻烦的是它拥有超多的HP和可怕的回复。玩者千万不要用物理属性攻击它，这只会助它回复HP。要使用火炎属性的合体魔法攻击它，才能追过它的回复速度。由于它的攻击力不强，因此只要有一个人负责回复工作便可。把它打倒之后，因为管原拥有不死之身，所以众人也没法杀掉它。于是达哉便把它打下太空船之底，作为它永远居住的地狱。舞耶她们在控制室四处搜索，可是仍找不能令太空船下降的办法。克哉同意达哉之前的说话，他们现在还未曾输，只要把龙藏和御前打败便可，于是克哉等人利用转送器离开了太空船。
第十七章~世界崩坏~
当众人来到珠闲留城之后，便看到女娲和伏羲之像。地下还有好像北斗七星的转移点，这些是到达各层的重要桥梁。在女娲和伏羲像之间的转移点，是到达2F的「反门之间」。要通过这扇门的话，便要在城内各层找寻不同的石板，并且记下密码，在门前输入「ソンジョウオウ」便可以进入。在房间之内会有很多的陷阱，只有一条路才不会跌下去。玩者只要看到地板上大星，跟着北斗七星的路线行，便可以安全到达房内的转移点，到达8F的@之间，找龙藏和御前决一胜负。在@之间内龙藏又干出了令人发指的行为，看到他手上的凶器，相信地上的人也是被他所杀。克哉等人看见他后的行为后，各人也觉得他已经疯了。龙藏却认为这世界才是疯了，因为世上的人也是有罪的，所以便要接受惩罚。不满他谬论的克哉和PAOFU与他口角，龙藏不理他们的指责，并且对那御前说要完成最后的工作。
他说完了那些话之后，珠留闲城的上空出现了曼陀罗的结界，那些被龙藏收集的污秽（JOKER）全部被释放出来。大地上立即产生反应，被神取他们解开了的龙，在世界各地苏醒过来。由于龙最讨厌污秽，因此便凶猛地向着TORIHUNE上空的罪扑去，因而令到产生极大的能量把大地破坏。看到这世界崩坏在即的龙藏，看来十分满意地狂笑起来。突然龙藏感到有些不妥，原来御前要奖励一下龙藏，把它变成和管原一样的怪物。看到龙藏自作自受的下场，众人决定送它上极乐之路。要把这个怪物龙藏打倒，最重要的是不能使用物理攻击，另外由于它所施展的魔法是以黑暗属性为主，玩者只要留意在这些特性去选择PERSONA作战，要战胜它一点也不难。另外，因为它的攻击力并非太强，因此回复的工作只要一人负责便可。
虽然众人把龙藏打败之后，可是天空上的龙和女娲仍未消失，如果再这样下去的话，后果便会不堪设想。PAOFU叫达哉把罪魁祸首的御前干掉时，地上被龙藏杀了的尸体，突然被御前吸收了，并且化身成为一只巨型的四足怪物。众人为了阻止继续被破坏的世界，便向那御前发出最后的一击。玩者一定要留意它的物理和魔法攻击也颇强劲，因此