为新的大地位于云端之上。每个人都对未来的生活感到兴奋。
但是移居亚特拉斯的资格非常严苛，加上随着碳税上涨，贫富差距不断扩大。人们才渐渐明白，亚特拉斯把他们手上的财产都抢走了。被森林驱赶出家园的百姓们，为寻求暂时的栖所而聚集到新大久保町去。镇上到处是「让新大久保町维持水泥原貌」的标语，数量竟比商店招牌还多。
某天，被森林逼到无处可去的桃子来到了这里。她穿着华丽的舞台装，上面原有的亮片全都掉光了，看上去活像是牙齿掉光的老人，她一定是在流浪途中受到暴力攻击，洋装的裙摆被撕掉了一大块。桃子一进入镇上，就在马路边坐下来。
就在那时，一群带着武器的男子围住桃子。
「等一下，那不是敌人！」
国子从公寓的阳台上大喊。年幼的国子被一位头戴钢盔的老婆婆抱在怀里。这位年老的女人是这个地区的精神领袖——凪子。她在前一阵子收养了一位预定继承她衣钵的养女，那就是国子。国子在很小的时候就拥有敏锐的感觉，她能瞬间判断来到镇上的人是敌是友。国子拥有的能力让新大久保町地区的秩序得以维持，不用担心内部发生斗争，或是政府派来的间谍会混进投奔此地的人当中。
国子身穿红色和服，伫立在桃子面前，然后用手碰了碰她掉妆的眉心。桃子先前累积的紧张感立即消失，当场睡倒在地。从那之后，桃子便担负起养育国子的责任。天生爱照顾人的桃子，把国子当成自己的女儿般细心呵护。
桃子经常待在瞭望塔的屋顶，让国子坐在自己的膝盖上。然后她会对国子诉说自己的梦想，直到亚特拉斯点灯那一刻为止。亚特拉斯的光芒看起来是那么神圣。
「总有一天，我要到那个城市去。只要它一直往上盖，我们迟早都能获准搬进去住的，所以现在必须好好忍耐。」
亚特拉斯计划把地面变成森林，是此地人们憎恶的对象。唯有桃子在说亚特拉斯时会讲到入迷。国子喜欢看着这样的桃子。她开口询问：「桃子阿姨喜欢政府的军队吗？」
「我讨厌有人用武器去威胁别人，因此政府军队或者金属世纪我都不喜欢。不过我很喜欢国子，所以你不能使用武器喔。」
「嗯。我不会使用武器的。因为啊，人家长大要当空中小姐嘛。」
国子从孩提时代就一直惦记着和桃子之间的这个约定。然而，她在成长过程当中只和金属世纪的成员们接触往来，因此，桃子总有一种预感，她认为国子总有一天会拿起武器参加反政府运动，这让她十分痛心。
后来，这个讨厌的预感成真了。
在国子被送往感化院的那一天，桃子哭着大声嘶吼。
两年前的那一天正好有暴雨侵袭，政府的军队占领了女子高中。军方对外的说词是要镇压在学校施放催泪瓦斯的歹徒，但真正的目的是为了抓走国子这位金属世纪未来的继承人，将她监禁起来。由于国子事前已预测到事态的发展，所以那一天她便从学校早退。她透过电视转播看见催泪气体从窗户向上窜，那是伪装成恐怖份子的军方干的。当军方得知国子不在学校时，便改为逮捕她的好友友香。
经过一番交涉之后，国子被移交给政府，身分是进行随机恐怖攻击的嫌犯。
自从国子成为人质之后，在这两年间，反政府游击队就没再进行任何明目张胆的行动。此外，政府间谍也可能混进镇里。指挥中枢遭到瘫痪的金属世纪，简直与被迫卸除武装无异。
在这段期间，森林所形成的包围网密实地向外延伸。和金属世纪合作的中野坂上地区因而解体，变成了一片森林，弱化了整个组织的实力。政府透过森林化，让反对势力无法行动。
当然，金属世纪也可以选择与政府摊牌，因为政府的诬陷行为显然严重违反法律。只要透过法律途径让真相曝光，那么，政府方面将会承受沉重的舆论压力。但是国子自愿选择成为人质。
理由只有一个：国子从小就能听见某种说话声，她想要和这说话声对话。为此，她认为自己必须暂时离开杂音过多的镇上。未成年人犯下恐怖行动罪的刑期是两年。国子认为自己必须在服刑时间和那个声音取得联系。相较于待在事事有人照料的金属世纪，无人照护的感化院里，个人空间比较多。
虽然国子听得见说话声，但听起来也只是一种声音。她无法分辨其中的涵义，那说话声到底想对自己传达什么呢？
凪子也知道这件事。
「该是觉醒的时候了。」
凪子只说了这句话便闭口不语，虽然她知道让国子离开只会让他们的处境更糟，但是她还是认为国子提早知道自己的命运比较好。国子现在需要知道的不是武器的用法，而是透过冥想的方式让自己觉醒。
国子对桃子这么说：「绝对不要上诉，我不会有事的，雨停了我就会回来。」
在国子离开的同时，身为监护人的凪子，也下令停止武力抗争。金属世纪就这么变成了失去利齿的武装组织。
这段期间，国子试着与说话声对话。为了彻底静下来，她也使用过刻意进入禁闭室的方式，并借此掌握说话声的来源。那说话声是从亚特拉斯传过来的。到了晚上，声音就会更加清晰。从亚特拉斯吹过来的风会释放特殊的低周波，风声中带着像是说话声一般的声音。
凪子她是这么说的：「你去出现话声的地方看看吧，那里就是你未来的归处。」
然而，对于国子他们来说，亚特拉斯是犹如禁忌般的存在。数百万人因为它而被迫过着难民般的生活。原本故乡是在其他地区的人还无所谓，但是那些被赶出住所、失去工作，却又不得不待在东京的人，究竟是以什么眼光看待亚特拉斯，国子对此有痛切的体会。所以，当她第一次听见那说话声之后，好几次说服自己那只是错觉。但是有一点国子心里深信不疑——亚特拉斯正在呼唤她。
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车子越靠近市中心，亚特拉斯就看起来越大。为了减轻地球重