「没事的，有我在你身边……有我在身边……」
一位少女正一边如此低语，一边用铅笔描绘着一幅粗略的图画。
她是日下部日和。
日和已经十七岁了。
身边停靠着日和骑来的单车。
日和所绘画的是涩谷陨石的图画。
但是这幅并不是风格写实的图画，而是在一个瓦砾废墟之中，一个蚁蛉的妖精女孩，正被天使温柔地守护着的图画。
日和只有在绘画这幅画的时候，才会展露出如此柔和的表情。
可是当她望到抬头所见的景象时，却令日和的表情，变得阴沉。
日和眼前的景象，是至今仍未被处理的涩谷废墟。
1
从涩谷被陨石击中的那一天起，至今已过了七年。
现在的涩谷，由当年曾经是车站的地点为中心，大约半径三百米的范围都成了堆满瓦砾的废墟，至今仍未被处理。
该处被铁丝网所包围，成了警戒严密的禁区。
而在铁丝网之外，都市的人们还是如常地过活。
但是人们都不知道。
在涩谷的地底，假面骑士系统的开发研究设施，却曾经存在于该处。
涩谷陨石正是为了狙击这个研究设施而坠落的。
亦因为涩谷陨石事件的关系下，同时令外星生物‘异虫'来到地球。
可是这一切也都从没被任何人所知晓。
2
「是异虫！」
密集排列着各式各样用以搜寻外星生物的最新机器的指挥车里，对抗异虫的战斗组织-ZECT的女队员岬佑月，正把总部传来的机密通讯，向她的上司田所修一进行报告。
「地点是？」
任何时候都非常镇定，同时只透出锐利目光的田所，向岬如此问道。
「在港湾地区C-3地点，ZECT蚁兵已经全体出动了。」
「那我们也尽快赶过去。」
ZECT的指挥车在被夕阳染红了的港湾街道上飞驰。
途中，从某处赶来的ZECT战斗员乘用车，开始与指挥车并排前进。
两辆有如装甲车般的重型车辆到达了港湾C-3地点，这是个仓库林立、杳无人烟的地方。
从ZECT的战斗员乘用车里，冲出了数十名ZECT蚁兵。
ZECT蚁兵是ZECT的主要战斗力，是配备了量产型通用特殊强化服的战斗部队。他们全身覆盖着以黑色为基调的战斗服和盔甲，头部以头盔保护，武器方面则配备了子弹3000发、每分钟能发射600发子弹的军刀机关枪，他们听从队伍领袖的指挥，如军队般对异虫进行歼灭行动。
ZECT蚁兵以井然有序的动作，前进到仓库的深处，发现了疑似由异虫所吐出的、具有高度黏性的蜘蛛丝、缠住了一名失去了意识的警卫。
ZECT蚁兵一边警戒着四周，一边确认该名警卫的安危。
警卫已经死亡。
突然，ZECT蚁兵遭到幼虫型异虫从暗处袭来的攻击。
「叽喳啊啊啊啊啊啊！」
昆虫般的咆哮声在仓库里回响。
锵哒哒哒哒哒哒哒！
ZECT蚁兵以军刀机关抢射击异虫。
但是即使枪击为异虫带来了某程度的伤害，异虫仍然以压倒性的力量向ZECT蚁兵进行反击。
ZECT蚁兵亦以军刀机关枪枪械前端、近身战用的利刃应战，但是面对宇虫坚硬的表皮，那完全起不了作用。
此时，一辆越野摩托车驶到了ZECT指挥车的旁边并停下。
摘下头盔，那是年轻的见习队员，加贺美新。
「加贺美！你来得太迟了吧！」
岬通过指挥车里的通讯机如此喊道。
「对不起！」
加贺美大声的抱歉，从袋子里取出了ZECT的录像机，专注地拍摄ZECT蚁兵和异虫作战的战况。
指挥车里并列着的荧幕上，出现了加贺美拍下的影像，以及各式各样的数据。
冷静沉着的田所经由通讯机的麦克风，以平稳的说道。
「别进行近身格斗。拉开距离，集中攻击面部。」
收到指示的ZECT蚁兵利落地与异虫拉开距离，用机关枪集中射击异虫的面部。
集中的炮火令异虫后退……但是，从屋顶上再跳出了两只幼虫型异虫，袭向ZECT蚁兵。
突如其来的新敌人，令ZECT蚁兵陷入混乱。
而且，透过加贺美传回来的影像，岬发现异虫体内的热能正急剧上升，于是她大喊道。