时光流逝，来到黎明二十年。
大海上的岛国『大和』，发生了与四季代行者相关的大騒动。
在这个由于列岛状似樱花树枝、人称东洋之樱的岛国，遭绑架的神回来了。
睽违十年再度归来的少女神，其名为花叶雏菊。
她是遭四季代行者的天敌『匪徒』掳走后便下落不明的春神，在忠诚的部下——代行者护卫官姬鹰樱随同下，展开了显现奇迹的旅行。
有人妨碍她，有人协助她，人们各种不同的想法交会。
春天主从在属于夏天主従的夏离宫静养时，受到了匪徒——四季代行者的天敌——攻撃。发
动攻撃的是激进组织【华岁】。
【华岁】不只针对夏离宫，也攻撃了秋天代行者祝月抚子与代行者护卫官阿左美龙胆居住的秋离宫。
宛如重演十年前花叶雏菊绑架案，改革派中势力最大的组织【华岁】掳走了秋天代行者祝月抚子。
接下来，事情出现了戏剧性的发展。
夏天主从应春天主従的请求，答应协助救出秋天代行者。
冬天代行者寒椿狼星与代行者护卫官寒月冻蝶也賛同这样的做法。
再加上秋天代行者护卫官阿左美龙胆，四季代行者与护卫官组成了春夏秋冬联合战线。
整起事件在四季厅与【华岁】的人质交渉破裂后，出现了急转直下的变化。
夏天主从与秋天代行者护卫官阿左美龙胆为救出祝月抚子，前往【华岁】基地。
春天主从在掌管季节营运的四季厅厅舍，遭到【华岁】攻撃部队的袭撃。
同一时间，冬天主从在赶往四季厅厅舍途中，遭受【华岁】的分队突袭。
在这火爆的一天，夏天主从应战匪徒，陷入危机。
在激战之中，瑠璃遭到狙击手从死角射撃，因而丧命。
菖蒲身为护卫官却没能保护最爱的妹妹，只能一筹莫展地看着她死去。
菖蒲为了妹妹的死后悔莫及，正打算跟随瑠璃的脚步时，秋天主从好不容易阻止了她。
幸运的是，抚子运用能力治疗瑠璃的身体后，夏天主从双双获救。
而这一连串的事件，在春天主从与冬天主従的奋战下，顺利解决。
春天主从在四季厅厅舍迎战【华岁】攻撃部队时，冬天主从前往救助，保护了她们的安全。
【华岁】的首领、其心腹与其他几名恐怖分子遭到逮捕，四季与匪徒的全面对战以四季的胜利收场，春天事件在此落幕。
尽管结局可称圆满，但后来发生了一个问题。即使是暂时的，夏天代行者叶樱瑠璃的确死了。
四季代行者一旦死亡，四季神明会立刻选出继任者。
自神治时代传承至今的一族里面，最适合的年轻生命会成为下一任的神。
神不知道是什么打算，选择了叶樱菖蒲成为下一任夏天代行者。
糟糕的是，在继任夏天代行者诞生的状态下，瑠璃复活了。
原本菖蒲现人神的能力理应遭到剥夺，但是不知为何力量没有消失。
前任夏天代行者瑠璃复活时，当然还保有能力。
史上第一次出现的双子神，使夏之里陷入了混乱。
人类讨厌无前例可循之事，在封闭的里更是如此。
在某种程度上能够料想，她们的存在受到了批判，这被认为是异常状况。
两人这样的状态是好是坏？在本人缺席的状态下，里召开了决定她们未来处境的会议。开会的结果，夏之里包括高层在内的人，为叶樱姊妹刻下了无情的烙印。
那烙印便是她们为『凶兆』。
她们扭曲惯例，存在本身象征了她们恣意妄为的行为。
人们高呼，不正常的人必须受到严格管理。
最后得出了结论，她们不只行动需要受到限制，连保存血脉一事也必须慎重。
废除双子神的婚约，这决定正是凶兆应受的处置。
这个世界上，根本没有人尊重瑠璃与菖蒲的意志。
此时，菖蒲正躺卧在叶樱家自己的房间里面。
房里乱得像经过强盗洗劫，正表现出她的精神状况。
她没有歌颂夏天，只是任时间流逝。
「菖蒲，对不起。」
瑠璃哭泣着，向如同尸体般躺在床上的菖蒲道歉。
「你会变成神都是我害的。对不起，我知道再怎么道歉也不够……对不起……我、我…… 那时候……那个时候……」
瑠璃的眼泪落到了菖蒲脸上。
——你为什么要道歉？
菖蒲也泪流满面。不，那到底是瑠璃还是菖蒲的眼泪，已经分不出来了。总之她因为对瑠璃感到过意不去，又自觉可悲，内心苦闷不已。