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夜幕低垂于第三卫星都市「碧阳」。
此时此刻，万家灯火一盏接一盏熄灭。
淡墨一片的天空浮现出闪闪烁烁的星星，有一轮尚未盈满的明月自浮云间绽放朦胧的辉光。
如此夜空下——
在租屋大楼其中一间房的客厅之中。
「啊——已经这个时间了！」
米索拉瞥了一眼桌上的时钟，长吁一声。
他是个发色接近深蓝，拥有一双黑眸的少年，体格就如一般青春期的少年，细瘦但匀实，脸上虽稚气未脱，但堪称五官清秀。
「这样算下来，光是今天就花了将近十个小时一直泡在书堆里……」
米索拉托着下颚。
他的目光停留于坐在四人座餐桌对面的少女身上。
「吶，飞儿，你看起来很想睡觉耶？」
「……我很困。」
少女揉揉合上一半的眼皮。
飞儿·妮斯斐莉亚·C4·安娜斯塔西亚。
她有一头在SIREN中很罕见的泛着银白的金黄色长发，而且被阳光照射到的部分就这么与光同化，充满神秘的发色，令人印象深刻。
另外还有一对宛如宝石般蔚蓝灿烂的大眼睛，再加上缥缈虚幻却又惹人怜爱的面容。
外表看来应该与米索拉一样在十七岁左右。她两肘抵着餐桌，右手握着笔，只差一点就会倒在桌面上。
「吃完晚餐后……为什么……会这么想睡啊？」
「你疲累是因为读太多书，从早上开始就一直持续苦读的关系。」
米索拉翻了翻拿在手上的生物学课本，悄悄克制住差点露馅的呵欠。
「不过，老实说，我想学园研究机构的入学考试应该没问题了。」
「真的吗！」
「会是怎样的考试内容得等明天正式进考场时才知道，不过题目范围是生物学与生化物工学，凭飞儿所知道的就足以应付了。」
「是。生化物工学的话，我有自信！」
尽管睡眼惺忪，飞儿还是坚毅地握起拳头。
她维持这个姿势目不转睛盯着眼前的人——
「嗯？怎么了吗？」
「通过这个入学考试之后，我就能够和米索拉一起去学园研究机构上学了。既然如此，我就要努力到最后。」
她露出赤子般无邪的纯净微笑。
这模样实在太过可爱，被她凝视的人反倒觉得害羞了起来。
「……喔，喔，只是不要太过勉强。」
「我会努力！」
飞儿一边揉眼睛一边回应。
……这举动也真的跟人类女孩并无不同呢。
……这下以「人类」身分进入学园研究机构中应该也不成问题。
这个叫飞儿的少女并不是人类，而是以次世代生命工学创造出来的次世代新生物，是由这世上生化物最高权威的研究学者，亦即米索拉的老师安娜斯塔西亚在三年前创造出来的「天使型生化物」。尽管平时隐藏起来，但她的背后其实长着比海洋也还要更深邃、美丽的碧蓝色翅膀。
然而，如果要举出更具特色的秘密……
——神性幻想种菲欧拉米莉丝。
大概就属这点了。在这世上被认为只存在于神话故事中的「真天使」，其精神世界就栖身在飞儿这个世上独一无二的生化物体内。
然而这份稀少性绝非飞儿本人希冀的命运。
首先是来自SIREN的统辖机构中央统合树的监视。
这种栖身了幻想世界真天使（菲欧拉米莉丝）的生化物，史无前例。对中央统合树而言，如此有价值的研究对象应该别无他有了。
「…………」
「吶，米索拉，关于这论文题目，这样回答合适吗？」
「……啊，喔。照我刚才教你的回答模式去写就没问题。」
米索拉从思绪中回神，瞧了瞧飞儿手中的笔记本。
——真天使的存在光是被人察觉就会带来危险。
——中央统合树不知会采取什么强硬手段来要求他交出飞儿。
不过，这份忧虑在不久之前便解决了。
米索拉正式以飞儿管理者的身分得到许可。换句话说，就SIREN全境看来，飞儿只不过是由人类管理的无数生化物之一，只要飞儿本身别做出什么事，中央统合树就不会察觉到有个真天使沉睡在飞儿体内。
因此米索拉最该心存警戒的对手便是早已察觉真天使存在的组织。
福音机关依斯加略。
从平行世界追着真天使来到此处的袭击者。
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