日本。
旗谷学园，冒险察地底。
一名青年爬下通往地底的梯子，沿着狭窄的通道走进巨大洞窟。
「世界的真理……如果是通往旧世界之路，就有可能在尽头找到世界的真理……但没想到那条路竟然就在母校内。」
那名青年自言自语，当场画出阴阳太极图，用手结印。
「开启吧，异界之门……以我身上神圣皇帝的一滴血脉，揭示命运与真理之路……」
青年一边灌注言灵，一边展开术式。
……忽然间，描绘在地面的阴阳太极图扭曲变形，显现某种影像。
「……人工……卫星？」
背对地球飘浮在宇宙空间，融合魔导与科学而诞生的人工卫星·魔导书之中的『神秘哲学』——感觉仿佛被那架人工卫星吸进去的同时，显现的影像变化为地球的地底景象。
「这是什么……？电脑……机房、吗？不对，有刻着卢恩文的器材，不是普通电脑，而是魔导机械吗……当作核心的是……什么？是卵……？」
简直就像是受到引诱般，青年的手很自然地伸向影像中的卵。
宛如上色失败的复活节彩蛋，颜色诡谲混杂的那颗卵。
照理说应该只是遥远某处的光景才对。
但在『物理接触』它的瞬间……
「！？」
卵出现裂痕，在比漆黑更加幽暗的裂痕深处……
……某人扬嘴一笑。
那是仿佛连背脊深处都会冻结、冰冷至极的浅笑。
接着，灵魂被一把抓住的感觉，让青年察觉到『糟了！』，晓悟自己碰了不该碰的东西。然而为时已晚，灵魂被拔掉的感觉让青年绝望。
然后……
在即将被拖进绝望深渊的青年面前，突然出现『某样东西』。
『某样东西』是……
《呼咦咦！？这里是哪里呀！？》
《鸣姊姊，居然呼咦咦……地尖叫。》
《现在不是在意那种事的时候吧！？》
是被Sacrament她们无预警地送进陌生空间，惊慌失措的鸣、胡桃子与琉璃。
《座标确认。这里是日本旗谷学园冒险察地底……侦测到异常，内建时钟回溯到最终记录往前五年的状态。》
另一个……俨然如人形机器人的琉璃，和先前的琉璃并排飘浮在空中，和她们一起出现的飒太瞠大眼睛。
《有两个琉璃！？》
《输出Y（是的）。人格代码：R0与R1，俗称：人类的我与人形机器人的我。现在包含飒太先生在内，我们六人与肉体分离，转化为没有实体的灵体状态。》
《灵体！？》
在惊讶的飒太背后，有名少女看到眼前的光景，比在场所有人都更加惊讶。
《哥……哥……哥……哥哥！？》
看到现在即将被抽掉灵魂的青年——圣帝小路隆守，他的妹妹美森为之惊愕。
听到美森的叫喊，飒太也大吃一惊。
《圣帝小路隆守吗！？》
本来身为血肉之躯的人类应该看不见、听不到才对。
然而，倒抽一口气抬头仰望的隆守的精神，确实捕捉到那些灵体的话语、以及身影。
「你是……美森！？」
没错。
隆守知觉到比自己所知还要成熟的妹妹。
但这时他无法有更进一步的作为。
因为隆守的精神，在机房那颗卵——位于布列德费尔德公国地底、用来控制魔导书的『暗黑的梦之卵』的力量作用下，与肉体分离了。
隆守失去意识的瞬间。
飒太等人也同样当场消失。
《这次是哪里呀！？》
然后，再度被丢到陌生场所的飒太等人之中，鸣率先提高嗓门大叫。
那里是伫立在恬静欧洲田园风景之中的郊外教会前。
《确认地形资料模组……是布列德费尔德公国西南方的米尔特村。》
人形机器人琉璃一冷静告知解析结果，鸣立刻瞠大眼睛。
《哎呀，是我出生的故乡呀！》
结果根本就不是陌生场所。
不仅如此，还是相当熟悉的场所。
《……你们那是什么眼神呀？》
《不，没事……》
那是不明白鸣为什么会变得如此废柴的眼神，但众人似乎决定不要继续追究。
《重点是刚才的哥哥是！？琉璃君说了五年前对吧……难道那